Im Obst- und Gemüsebau oder Weinbau können Pilz- oder Schädlingsbefall weitgehend eingegrenzt werden. Der besondere Erfolg der EM´s im Einsatz gegen Pilzerkrankungen ist das Platzhalterprinzip. Über die Milieulenkung werden ansässige Pilze verdrängt und durch die Hefekultur aus dem EM ersetzt.

Im Ackerbau wird die Bodenfruchtbarkeit positiv unterstützt und aufgebaut. Zusätzlich wird das Wurzelwachstum angeregt und die Pflanzen dadurch widerstandsfähiger und ertragreicher.